Размер логотипа изменяется в CSS коде.

Например, если высота логотипа 100 пикселей, нужно добавить такую строку на странице Пользовательский CSS (Страница “Интерфейс” -> “Пользовательские CSS и JS” -> вкладка “Пользовательский CSS”):

@media (min-width: 992px) {
#logo, .company-logo {
  height: 100px;
}
}

#logo img, .company-logo img {
  max-height: 100px;
}